正在阵中的秦军主帅苻融见状大惊，根本就不像他想象的那种样子，秦军撤退之中竟然成了溃退。他大喊着：“全军注意，稳住阵势！稳住阵势！”
    可是在隆隆炮声之中，哪里还有人听到他的命令。于是苻融骑着战马，带领着少数卫队，往来奔驰，大吼着：“稳住阵势！稳住阵势！”斩杀了几名逃跑的士兵，还是控制不住溃逃的阵形。就在这时候，一发炮弹飞来，战马受伤倒地，苻融刚爬起来，一队晋兵就冲杀过来。
    侍卫慌忙上去迎战，纷纷不敌晋兵，败下阵来。苻融没了战马，跑又跑不快，换马都来不及，一阵马蹄卷过，苻融竟被砍杀阵亡。
    群龙无首，秦军更是乱中愈乱，个个抱头鼠窜，争先逃命，纷纷沿着淮河，向着寿阳城狼奔豕突。步骑兵早已破了建制，兵找不到官，官找不到兵。在这拼命逃窜的败兵之中，朱序乘机领着一些降将，高声呼喊：“秦军败了——秦军败了——”
    溃兵一见连自己的将领都这样呼喊，更认为秦兵大败无疑，更加慌乱，慌不择路。朱序趁机缴获了秦王苻坚所乘坐的车乘，光明正大地投降了东晋。秦王苻坚呢，在侍卫的保护下，换上战马，向着寿阳城逃去。
    谢石、谢玄领着大军奋勇追击，一直追到寿阳城下，但见一路上前秦军队自相践踏，士兵的死尸沟沟坎坎到处都是，连道路都堵塞了。
    苻坚站在寿阳城头上，看到东晋的军队越围越多，晋军绝不像他想象的那样，但见布阵严整，一队队，一列列的极有章法。又见侧面的八公山上，芳草萋萋，树木葱葱，一阵风刮来，远处的草木都动了起来，以为山上已经布满了晋国的兵马。
    他对身边的淮南太守郭褒大惊道：“莫不是晋军到了八公山上，看来寿阳也不保险。”
    郭褒是个近视眼，根本就看不清八公山上的军情，手搭凉棚，观察了一会儿，也看不出个究竟来，赶紧对皇上苻坚说：“陛下啊，龙体要紧，还是请陛下撤退吧，容小臣在寿阳挡住晋兵。”
    当然苻坚都跑了，寿阳还能守住吗，早叫投降东晋的朱序攻下寿阳，活捉了淮南太守郭褒。
    苻坚到了此时也没有什么办法，只好领着大军继续撤退。逃跑的人听到刮风的声音和鹤的鸣叫，都以为是东晋的军队来到，昼夜不停地向西逃跑。再加上天又冷了，风餐露宿，冻饿交加，死亡的人十有八九。
    跑着跑着，苻坚和大部队失去了联系，胳膊上也中了流矢，侍卫慌忙给他包扎上，止住血。又跑了一阵子，连侍卫也不知道哪里去了，只剩下单人独骑往西逃窜。天已黑了，到处是东晋追兵的火把，满地是溃逃的士兵，前秦早已失去了抵抗的信心。
    一晚上在疲于奔命中度过，好几次差点儿被晋兵抓住。到了天明，早已人困马乏，饿得饥肠辘辘，看到村外有一处草房。苻坚只得放下身份，上前讨饭：“老大爷，能不能施舍口饭吃？”
    那个农人也算好心，急忙拿了一个窝窝头送给苻坚。苻坚抢过窝头，三口两口吞下，心里才稍微安稳些，说了句：“朕从来没有吃过这么好吃的饭食！”
    那个农人听到此话大吃一惊，再看苻坚的穿戴，虽然极其落魄，却是穿着龙袍，只是一路奔波，早已脏破不堪，赶紧给苻坚跪下，说：“小民面见陛下，祝皇上万岁！万岁！万万岁！！”
    苻坚一时高兴，随口说了声：“朕赏赐给帛10匹，绵10匹。只是现在没有，欠着。待朕回到长安后，一定给你送来。”
    这个农人嘴也挺巧，赶紧说：“陛下从没有吃过苦，现在在困苦之中，小民为陛下子民，陛下为民之父，哪有照顾父亲而要求回报的？”
    正在此时，几个近臣和太监寻了来，见了苻坚，忙前忙后的。苻坚哭了，流着眼泪对他们说：“现在，我有什么面目治理天下，有什么面目面对爱戴我的人民。王景略呀，我想你呀！后悔不该不听你的话呀！”
    此时后面追兵又至，苻坚只得放弃了对王猛回忆，继续向西逃窜。就这样一直退了600公里，到了洛阳才算收住阵脚，然后收拢残兵败将，近百万大军，只回来了10余万人。
    晋军收复寿阳的消息，谢石派飞马往建康报捷。当时谢安正跟客人在家下棋，看完了谢石送来的情报，不露声色，随手把捷报放在旁边，继续下棋。客人知道这是前方送来的战报，忍耐不住，问：“不知前方的战事怎么样了？”
    谢安却说：“咱下咱的棋，管这么多事干什么。”
    客人却忍不住了，大呼道：“为什么到你这里来下棋，就是想听听前线的情况。如果我们败了，还有心在这里下棋吗，早赶紧逃命去了。”
    谢安这才不咸不淡地说：“也算万幸，孩子们总算把秦人打败了。”
    客人再也按捺不住自己的兴奋之情，把棋一推，就要去告诉别人。谢安却不让他走，“干活干完，下棋下了，这盘棋还没有下完，你怎么能走呢！”
    客人高兴得大叫道：“高兴得我的心都快蹦出来了，哪里还有心下棋。丞相愿意找谁下就找谁下，我是不能陪你下了。”
    谢安送走客人，回到屋里，兴奋心情再也控制不住，跨过门槛的时候，踉踉跄跄满脸涨红，连木屐的带都碰断了。
    苻坚回到长安后，哭着悼念苻融和牺牲的诸将，并大赦天下，还下令锻炼兵器和监督务农，安抚孤老及阵亡士兵的家属，妄图东山再起重建破败的秦国。
    然而淝水之战后，前秦的颓势已定，各少数民族岂能放过这样乘机起事的大好机会？太元九年（384年）正月，前秦终于爆发内乱。首先在北方，慕容垂在淝水之战中一点儿也没有受到损失，找了个借口说要回家发丧，带着自己的宗族和军队脱离前秦，与丁零部落首领翟斌相呼应，重新竖起燕国的大旗，史称后燕。